费用类型自行设定是系统用户可根据自身冷库的实际业务情况，自由设定冷库业务会涉及到的各项费用，例如：冷藏费与其他各项杂费。
不同的冷库企业，所涉及到的相关业务也不一样，如有些冷库以储存果品为主，一些冷库又以储存速冻食品为主等等，那么，将会产生不一样的业务费用。如果一些冷库没有过车业务，那过车费用自然就不会出现。假如一些冷库的实际操作把搬运费一起归并到冷藏费里，那么杂费里就不能再出现搬运费用。冷库管理系统按照冷藏费与杂费分离的算法，适合大部分冷库企业的实际业务形式。因为冷藏费是冷库企业业务结算的核心费用，与杂费分离计算，将会更清晰明了地体现冷库企业的利润收入，对于成本的核算也更加便利。
本系统主要按吨计算冷藏费即（件数*件重=计费重量），出库按件出库，出库计费重量按（件数*件重=出库重量）处理，也可实现包仓形式入库。在计费结算上，冷库管理系统也可按日结算费用，也可按指定天数为一期进行计费，由冷库企业自由选择。
费用类型自行设定，就是考虑到各冷库企业冷藏费计算方式不一样，各项实际业务有所区别，从而研发的功能模块。自行设定费用，让用户灵活操作冷库管理系统，避免一些不必要的繁杂错乱现象的发生。